Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC9Q9Y397 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC9Q9Y397 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC9Q9Y397 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC9Q9Y397 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC9Q9Y397 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC9Q9Y397 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZDHHC9Q9Y397 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms