Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR3KQ9Y2Y1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR3KQ9Y2Y1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms