Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAN1Q9Y2M0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAN1Q9Y2M0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms