Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFSF13BQ9Y275 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF13BQ9Y275 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms