Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOD1Q9Y239 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOD1Q9Y239 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms