Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTNND2Q9UQB3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTNND2Q9UQB3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms