Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SORCS3Q9UPU3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SORCS3Q9UPU3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms