Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PLA2G4CQ9UP65 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PLA2G4CQ9UP65 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms