Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CIZ1Q9ULV3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CIZ1Q9ULV3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms