Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNMA8BQ9ULN7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PNMA8BQ9ULN7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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