Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJD2Q9UKL4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms