Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDC23Q9UJX2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDC23Q9UJX2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms