Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIMS3Q9UJD0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RIMS3Q9UJD0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms