Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SMPXQ9UHP9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms