Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTF2IRD1Q9UHL9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2IRD1Q9UHL9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms