Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP2Q9UHC6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTNAP2Q9UHC6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms