Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
KDM5BQ9UGL1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
KDM5BQ9UGL1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
KDM5BQ9UGL1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms