Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ERVK-18Q9QC07 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ERVK-18Q9QC07 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms