Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms