Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTN3Q9P232 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms