Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP5Q9NZZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms