Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NINJ2Q9NZG7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NINJ2Q9NZG7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms