Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY99

SNTG2, Gamma-2-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG2Q9NY99 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SNTG2Q9NY99 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTG2Q9NY99 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTG2Q9NY99 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNTG2Q9NY99 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms