Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A4Q9NY91 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms