Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDND1Q9NY35 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDND1Q9NY35 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms