Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.223e-10■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.964e-8■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 LRRC61-203ENST00000463441 667 ntTSL 224.4■■□□□ 1.54e-8■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.34e-8■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.494e-8■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 CERS2-214ENST00000561294 1803 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 31.3
RBM22Q9NW64 CNIH1-206ENST00000557659 856 ntTSL 211.61□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 CNIH1-202ENST00000395573 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 CNIH1-204ENST00000554683 787 ntTSL 310.81□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-7■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.683e-9■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 520.75■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 216.42■□□□□ 0.221e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 31.2
RBM22Q9NW64 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.428e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.168e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 SEPT9-225ENST00000589250 527 ntTSL 29.63□□□□□ -0.871e-16■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 BCL2L1-208ENST00000450273 894 ntTSL 318.07■□□□□ 0.483e-10■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.243e-10■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-10■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 EIF4A2-201ENST00000323963 1919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.777e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 EIF4A2-203ENST00000426808 1751 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.267e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 EIF4A2-207ENST00000443963 1729 ntTSL 1 (best)6.82□□□□□ -1.327e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.357e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 EIF4A2-204ENST00000429589 1005 ntTSL 55.9□□□□□ -1.467e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 EIF4A2-202ENST00000425053 1977 ntTSL 55.73□□□□□ -1.497e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 EIF4A2-219ENST00000485101 5327 ntTSL 54.31□□□□□ -1.727e-8■■■■■ 31.1
RBM22Q9NW64 SET-209ENST00000480217 509 ntTSL 514.44□□□□□ -0.19e-13■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SET-207ENST00000466009 597 ntTSL 310.06□□□□□ -0.89e-13■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SET-210ENST00000480536 388 ntTSL 24.92□□□□□ -1.629e-13■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-210ENST00000504549 980 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 HNRNPH1-247ENST00000523921 584 ntTSL 211.68□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 TXNRD1-216ENST00000527335 786 ntTSL 511.29□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 TXNRD1-223ENST00000531691 728 ntTSL 210.89□□□□□ -0.679e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 TXNRD1-211ENST00000526266 577 ntTSL 49.84□□□□□ -0.839e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 TXNRD1-222ENST00000531689 554 ntTSL 49.15□□□□□ -0.949e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 TXNRD1-213ENST00000526580 400 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.029e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.222e-12■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 ADSS-202ENST00000462358 932 ntTSL 54.49□□□□□ -1.692e-12■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 221.9■■□□□ 1.13e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-208ENST00000481072 836 ntTSL 213.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 SEPT6-207ENST00000467310 1061 ntTSL 39.36□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 ANK1-209ENST00000520299 3587 ntTSL 29.55□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.213e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 220.96■□□□□ 0.953e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 31
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-220ENST00000588901 589 ntTSL 218.02■□□□□ 0.489e-7■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-224ENST00000592324 585 ntTSL 46.93□□□□□ -1.39e-7■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 ATP6V0A1-222ENST00000589727 664 ntTSL 56.13□□□□□ -1.439e-7■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.244e-8■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.514e-8■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 STIL-202ENST00000360380 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 STIL-209ENST00000447475 2984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AL132780.3-201ENST00000555074 835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.737e-10■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AKT2-203ENST00000391844 1795 ntTSL 1 (best)24.78■■□□□ 1.564e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.124e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.094e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-207ENST00000600467 420 ntTSL 221.26■□□□□ 0.993e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AKT2-240ENST00000584288 1706 ntTSL 220.04■□□□□ 0.84e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 516.13■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 ASGR2-206ENST00000576487 1055 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 214.44□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-204ENST00000598399 1172 ntTSL 512.94□□□□□ -0.343e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AKT2-216ENST00000476266 3309 ntTSL 512.52□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 AKT2-201ENST00000311278 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.414e-6■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 312.01□□□□□ -0.493e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-205ENST00000598466 601 ntTSL 211.96□□□□□ -0.493e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 RPS19-208ENST00000601492 342 ntTSL 58.08□□□□□ -1.123e-20■■■■■ 30.9
RBM22Q9NW64 ZNF207-211ENST00000579810 979 ntTSL 58.2□□□□□ -1.16e-13■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.093e-8■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 CAP1-204ENST00000372798 1563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 CAP1-202ENST00000372792 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 30.8
RBM22Q9NW64 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 30.8
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 91.1 ms