Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD4Q9NVD3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD4Q9NVD3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms