Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MED17Q9NVC6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MED17Q9NVC6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms