Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM30AQ9NV96 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM30AQ9NV96 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms