Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UFSP2Q9NUQ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms