Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINM1Q9NU53 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GINM1Q9NU53 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINM1Q9NU53 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms