Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP8A2Q9NTI2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP8A2Q9NTI2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms