Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CENPMQ9NSP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms