Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSBQ9NSD9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FARSBQ9NSD9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms