Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LTBP3Q9NS15 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LTBP3Q9NS15 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
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