Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNNM1Q9NRU3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNNM1Q9NRU3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms