Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PAPOLBQ9NRJ5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms