Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF3Q9NR81 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF3Q9NR81 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms