Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GDF3Q9NR23 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDF3Q9NR23 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms