Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CRTAC1Q9NQ79 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRTAC1Q9NQ79 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms