Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNK9Q9NPC2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNK9Q9NPC2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms