Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPCPD1Q9NPB8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPCPD1Q9NPB8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPCPD1Q9NPB8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms