Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZCCHC17Q9NP64 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZCCHC17Q9NP64 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms