Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD248Q9HCU0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms