Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EPB41L4AQ9HCS5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EPB41L4AQ9HCS5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms