Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CENPJQ9HC77 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms