Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A3Q9HAS3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A3Q9HAS3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms