Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LIN28AQ9H9Z2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms