Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TDRD3Q9H7E2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TDRD3Q9H7E2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms