Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
BCAS3Q9H6U6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BCAS3Q9H6U6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms